黄寺位于安定门外黄寺大街。有东黄寺和西黄寺，故称双黄寺。 东黄寺又名普净禅林，建于清顺治八年(1651)，是为治佛脑木汗所建，西黄寺建于顺治九年(1652)，达赖喇嘛五世在当年12月来京时住此。顺治十年(1653)，达赖刺嘛辞归。乾隆四十五年(1780)，班禅额尔德尼六世来京，清高宗指定把五世达赖曾经住过的西黄寺作为他的安禅之所。
现今的西黄寺中设有中国藏语系高级佛学院，在十世班禅大师和中国佛教协会赵朴初会长的倡导下，该院得到人民政府的支持，于1987年创建。
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